Eugen,<div><br></div><div>I am certainly interested ! </div><div>I touched on the Gromacs port to ClearSpeed when I worked there - I then went on to write the port of AMBER to CS<br>plus I have a pair of RPis that I tinker with.<br>
<br>Simon Cox at Southampton did a publicity stunt recently - building a 64node RPi cluster with his young son and his Lego bricks.</div><div>So far though no news of him running any scientific applications. Perhaps you two should collaborate?</div>
<div> <br>Daniel</div><div>Bull Information Systems<br><br><div class="gmail_quote">On 31 August 2012 15:57, Eugen Leitl <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:eugen@leitl.org" target="_blank">eugen@leitl.org</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
<a href="http://www.reddit.com/r/comp_chem/comments/z2rqr/gromacs_on_the_raspberry_pi/" target="_blank">http://www.reddit.com/r/comp_chem/comments/z2rqr/gromacs_on_the_raspberry_pi/</a><br>
<br>
GROMACS on the Raspberry Pi (self.comp_chem)<br>
<br>
submitted 1 day ago by steelgargoyle<br>
<br>
As we all know our discipline tends to involve rather a lot of waiting<br>
around. In my downtime I decided, having heard that GROMACS can compile on<br>
ARM CPUs, to attempt to compile it on my Model B RPi. I dug out an old<br>
sequential Bash script I wrote which sorts the FFTW libraries out for you,<br>
and it actually worked.<br>
<br>
I haven&#39;t tested it yet with any simulations, because I&#39;m actually an AMBER<br>
user nowadays and I&#39;ve forgotten how to use GROMACS so I need to brush up,<br>
but if it works well I&#39;m hoping to get another one to test the feasibility of<br>
MPI GROMACS on RPis as part of a small low-power Beowulf cluster, though the<br>
ethernet speed could limit data transfer rates.<br>
<br>
Thought this is probably the most appropriate place to post this. Let me know<br>
if you&#39;re interested and if you have any ideas.<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Beowulf mailing list, <a href="mailto:Beowulf@beowulf.org">Beowulf@beowulf.org</a> sponsored by Penguin Computing<br>
To change your subscription (digest mode or unsubscribe) visit <a href="http://www.beowulf.org/mailman/listinfo/beowulf" target="_blank">http://www.beowulf.org/mailman/listinfo/beowulf</a><br>
</blockquote></div><br></div>