thanksa lot its working<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 9, 2010 at 12:14 AM, Don Holmgren <span dir="ltr"><<a href="mailto:djholm@fnal.gov">djholm@fnal.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>
You should add, as the second line,<br>
<br>
#PBS -S /bin/csh<br>
<br>
else PBS will (I think) use your default login shell, which I assume is<br>
not csh (explaining the "setenv" error message).<br>
<br>
Also, you have a typo.  You should have<br>
<br>
echo "NPROCS is $NPROCS"<br>
  instead of<br>
echo "NPOCS is $NPOCS"<br><font color="#888888">
<br>
Don Holmgren<br>
Fermilab</font><div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
On Wed, 7 Apr 2010, akshar bhosale wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi,<br>
we have cluser of 8 nodes and it is rhel 5.2 (64 bit). We have torque and<br>
here is my submit script which is<br>
#!/bin/csh -f<br>
#PBS -l nodes=2:ppn=2<br>
#PBS -r n<br>
#PBS -A ourproj<br>
#PBS -V<br>
#PBS -o output_pvd3.6.txt<br>
#PBS -e error_pvd3.6.txt<br>
echo PBS JOB id is $PBS_JOBID<br>
echo PBS_NODEFILE is $PBS_NODEFILE<br>
echo PBS_QUEUE is $PBS_QUEUE<br>
setenv NPROCS `cat $PBS_NODEFILE|wc -l`<br>
echo "NPOCS is $NPOCS"<br>
#/opt/intel/mpi/bin64/mpirun --totalnum=$NPROCS --file=$PBS_NODEFILE<br>
--rsh=/usr/bin/ssh -1 --ordered --verbose -l -machinefile $PBS_NODEFILE<br>
-np $NPROCS /home/aksharb/helloworld<br>
#sleep 100<br>
/bin/hostname<br>
cat $PBS_NODEFILE<br>
<br>
<br>
in output file i get<br>
<br>
PBS JOB id is 1725.server1.gnps.tkl<br>
PBS_NODEFILE is /opt/PBS/aux//1725.server1.gnps.tkl<br>
PBS_QUEUE is batch<br>
NPOCS is<br>
y8.gnps.tkl<br>
y8.gnps.tkl<br>
y7.gnps.tkl<br>
y7.gnps.tkl<br>
<br>
and error file says :<br>
/opt/PBS/mom_priv/jobs/<a href="http://1725.server1.gnps.tkl.SC" target="_blank">1725.server1.gnps.tkl.SC</a>: line 11: setenv: command<br>
not found<br>
<br>
kindly guide me.<br>
<br>
</blockquote>
<br></div></div><div><div></div><div class="h5">
_______________________________________________<br>
Beowulf mailing list, <a href="mailto:Beowulf@beowulf.org" target="_blank">Beowulf@beowulf.org</a> sponsored by Penguin Computing<br>
To change your subscription (digest mode or unsubscribe) visit <a href="http://www.beowulf.org/mailman/listinfo/beowulf" target="_blank">http://www.beowulf.org/mailman/listinfo/beowulf</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>